Die Gemeindeverwaltung von Muri wird seit dem 1. Juni 2012 im Geschäftsleitungs-Modell geführt. Die Geschäftsleitung ist für die operative Führung der Verwaltung zuständig. Die Geschäftsleitung entlastet den Gemeinderat von fachlichen und personellen Führungsaufgaben. Der Gemeinderat kann sich auf die politische Steuerung der Ressorts konzentrieren.
Der Geschäftsleitung gehören der Gemeindeschreiber (Geschäftsleiter) sowie die Leitenden der Abteilung Finanzen (Geschätsleiter-Stv.) sowie Bau und Planung (Mitglied). Der Gemeindeschreiber nimmt die doppelte Funktion der Stabsstelle der Exekutive und des Vorsitzenden der Geschäftsleitung ein.
Die Geschäftsleitung tagt wöchentlich am Mittwochmorgen.